請求代行と決済代行はその仕組みが大きく異なり、混同すると様々なトラブルを発生させるため注意をすることが必要です。一般的に請求代行は債務が発生する対象に対して請求業務を依頼するものであり、実際の入金の手続きやその他の処理等は行わないため、これらは自ら行うことが必要となります。決済代行は入金やその他の書類を請け負うものとなっており、入金方法のスムーズさや代金回収の利便性などを向上させるために効果的なものとなっていることから、自ら回収をする場合に比べその利便性が向上する仕組みとなっています。請求代行は近年では決済代行とセットで行われることが多く、請求書の送付から実際の回収の手続き、及び様々な事務作業などを一手に行うことが少なくありません。
これらの業務を委託することで個別に依頼する場合とは違い、煩雑な業務を簡略化することができるのがポイントです。一般的に日本の場合には商品等を納入した後、代金の請求を行い一定期間内に支払いを行わせることが通常です。請求代行はその請求書発行を行う業務となっており、これを行ったら終わりとなるのに対し、決済代行は支払いを行う際にその手続きを代行するものとなっています。業務プロセスに違いがあるためどちらかとのみ契約をすると、代金回収がスムーズに進まない場合が少なくありません。
これらの違いを十分に認識し、業務が滞りなく進むように考慮しながら利用することがポイントとなっています。